1 — что за группа? как там оказались Алекс и его родители?
2 — в 51 Душ еще не уничтожали, они едва появились, их не принимали всерьез. Может, они погибли от рук бандитов, как вариант?
3 — Ну и в чем Души отобрали лучшего друга, если он сам был Душой?

Группа Виктора и Энни образовалась еще на территории Германии в первые месяцы масштабной катастрофы. В поиске убежища группа, состоящая из десяти крепких мужчин, пяти женщин и трех подростком, наткнулась на другую совсем маленькую группу выживших, где были лишь одни женщины и дети, один мужчина был во главе. Они увидели друг в друге надежду и выгоду, а потому решили объединиться. Как оказалось после, у второй группы был свой большой бункер, до которого им сложно добраться. Поможем? Помогли. И вплоть до 2055 года они жили там, имея крепки стены, собственные сохраненные культуры, которые выращивали на небольшой агроплощадке, жалкое количество техники и небольшой арсенал оружия. За эти долгие годы к ним присоединились еще несколько одиночек, а также появилось на свет трое детей.

Переломный момент, 2051 год, оказался слишком тяжелым. В их небольшой группе оказалась Душа — светловолосый мальчишка, с которым Алекс очень сдружился. С годами вся группа подверглась жуткому давлению, но отчаянно старалась скрыть его. За что в 2055 году и была перебита почти треть из них, бункер превратили в место схватки, где уничтожили все, ради чего жили люди. Семье Александра и еще около десятка человек удалось спастись, после чего они отправились в Прагу 2.0.

ему специально внушили, что Души — это страшный вирус, который поразит всех, если не научиться с ними драться, поэтому силком вытолкнули мальчишку к Охотникам, чтобы в нужный момент рассказать всю правду, когда он станет доверенным сотрудником;

Мы, конечно же, будем пытаться выяснить этот момент вместе с Алексом, но для истории хотелось бы быть в курсе подобной мистики. Просьба уточнить, что это были за обстоятельства, мы жаждем подробностей)

На самом деле в тайне от сына его отец и мать собирали команду людей, у которых власти силой отобрали детей — Души — они были категорически против, эдакое сопротивление; поэтому главной идеей Виктора стал засланный в охотники сын; ему специально внушили, что Души — это страшный вирус, который поразит всех, если не научиться с ними драться, поэтому силком вытолкнули мальчишку к Охотникам, чтобы в нужный момент рассказать всю правду, когда он станет доверенным сотрудником; но они не успели, потому что в рядах команды Виктора был предатель, который все сообщил властям; группу Виктора затащили в ловушку и хладнокровно уничтожили, а затем добрались и до остальных, тихо и бесшумно устранив всех, кто с ними был связан, кроме Алекса, который, как посчитали власти, не в курсе всего, потому и не рассказали мальчику правду, сославшись на неопознанных разбойников.

там — где?)

По поводу оружия есть несколько моментов:
Учитывая дефицит дерева, рискнём предположить, что нунчаки были сделаны еще до войны, если после — их лучше убрать или поменять материал.
Откуда у отца самурайский меч? С немецкими корнями родителей все понятно, но они не объясняют этой неожиданной японской ветки. Нужен обоснуй для такого внезапного поворота, но лучше просто замени на мачете или какой-то еще менее экзотический мечик (:

В ряды Псов попадают самые опытные, взрослые и т.п.
Алекса бы и не взяли к Псам пока

мечтает в будущем стать одним из бойцовских псов, поэтому усиленно готовится к этому;

откуда этот навык — хобби?)

0 довольно хорошо разбирается в технике, но не демонстрирует сий талант, чтобы его не использовали (научился этому, когда с группой жили в бункере, где техника была с ними рука об руку);

на доходы с чёрного рынка Руслан открыл подпольный клуб.

Отлично владеет метательным ножом, хорошо стреляет из пистолета.

Когда очень волнуется или сердится, цвет глаз темнеет, вплоть до чёрного.

или просто бросила где-нибудь бросила как обузу